食中毒を起こす菌の大半は、75度の加熱を1分（ノロウイルスは85～90度で90秒）以上で死滅します。中まで火が通りにくいものはふたをして加熱します。

出典:作りおきおかずとお弁当のコツ(食中毒対策)まとめ

菌が繁殖する原因のひとつが水分。しっかり火を通すとともに、水分を極力とばすことが大切です。

出典:作りおきおかずとお弁当のコツ(食中毒対策)まとめ

塩や砂糖を加えると食品中の水分が減ります。

出典:作りおきおかずとお弁当のコツ(食中毒対策)まとめ

最近が繁殖しやすいのは、20～35度といわれている。ご飯やおかずはしっかりと冷ましてから詰めよう。温かいままフタをすると、湯気が水滴になり、お弁当が痛む原因に。詰める時も、手についた殺菌が繁殖しないよう、必ず菜箸を使おう。

出典:知ってる？　冷めてもおいしい＆痛まない！　お弁当作りの基本

汁が出て、おかずが傷む原因になるのでNG。この季節はピックの使用を控えましょう。おかずを入れるカップや、間にはさむバランは使っても大丈夫。プチトマトは細菌のついている確率の高いへたを取り、しっかり洗って水けを拭きます。切らなければ水けが出ないので、生のまま詰めてOK。

出典:梅雨時の不安解消！ 傷みにくいお弁当作りのコツ｜食の安全｜PRESIDENT Online

特に注意したいのは、おにぎり。ご飯はしっかりと冷まし、手を洗った後、必ずラップを使って握りましょう。ラップで握ったおにぎりとおかずを隣り合わせで入れるのも、うっかりやりがちですが、手からラップに菌がうつっている可能性があるのでNGです。

出典:もっとも気をつけたい！「夏のお弁当」の衛生対策

手軽でお弁当に彩りを添えるのに便利なレタスやきゅうりなどの生野菜ですが、加熱しない野菜はよく洗っても土壌菌がついている可能性のあるので、この時期加熱をしないで生で入れるのは避けるべき。時間が経つと、おかずの塩分で生野菜から水分が出て菌の増殖の原因にもなります。生野菜をはさんだサンドイッチもこの時期は避けましょう。お弁当に彩りをというときにはへたを取って洗ってしっかり水気を拭き取ったプチトマト、茹でる焼くなど加熱をした彩り野菜がお薦めです。

出典:初夏から夏の時期に！気をつけたいお弁当作りの衛生ポイント 〜vol.2　おかず編〜